Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20830J3KML6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20830J3KML6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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