Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20696H3BJN7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm20696H3BJN7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20696H3BJN7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20696H3BJN7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20696H3BJN7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20696H3BJN7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20696H3BJN7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20696H3BJN7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms