Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r58G3X9U3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms