Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf148G3X9R7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rnf148G3X9R7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnf148G3X9R7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms