Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zkscan2G3X952 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zkscan2G3X952 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zkscan2G3X952 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms