Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim55G3X8Y1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim55G3X8Y1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim55G3X8Y1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim55G3X8Y1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim55G3X8Y1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim55G3X8Y1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim55G3X8Y1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim55G3X8Y1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim55G3X8Y1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim55G3X8Y1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim55G3X8Y1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms