Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim15G3UY57 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms