Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn34aG3UW52 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms