Protein–RNA interactions for Protein: F8VQK7

Gm16519, Predicted gene, 16519, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16519F8VQK7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm16519F8VQK7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm16519F8VQK7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm16519F8VQK7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm16519F8VQK7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16519F8VQK7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16519F8VQK7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16519F8VQK7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16519F8VQK7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16519F8VQK7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16519F8VQK7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16519F8VQK7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16519F8VQK7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16519F8VQK7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16519F8VQK7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16519F8VQK7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm16519F8VQK7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm16519F8VQK7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm16519F8VQK7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm16519F8VQK7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm16519F8VQK7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm16519F8VQK7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm16519F8VQK7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm16519F8VQK7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms