Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
5830473C10RikF8VQ07 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
5830473C10RikF8VQ07 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms