Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Speer4aF8VPX6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Speer4aF8VPX6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4aF8VPX6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4aF8VPX6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.9 ms