Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm5160F8VPN3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5160F8VPN3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm5160F8VPN3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms