Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M1F7CXU4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-M1F7CXU4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms