Protein–RNA interactions for Protein: F6ZR08

Gm15056, Predicted gene 15056, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm15056F6ZR08 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm15056F6ZR08 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm15056F6ZR08 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm15056F6ZR08 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm15056F6ZR08 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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