Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdh11xF6ZNL5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdh11xF6ZNL5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms