Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm20538F6Z9R1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms