Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sptbn5F6UCX4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sptbn5F6UCX4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms