Protein–RNA interactions for Protein: F2YMG0

Prss56, Serine protease 56, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss56F2YMG0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prss56F2YMG0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prss56F2YMG0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms