Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdzd7E9Q9W7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdzd7E9Q9W7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms