Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtproE9Q612 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtproE9Q612 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtproE9Q612 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms