Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930579F01RikE9Q3L6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930579F01RikE9Q3L6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms