Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc171E9Q1U1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ccdc171E9Q1U1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
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