Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930426L09RikE9Q0N7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930426L09RikE9Q0N7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930426L09RikE9Q0N7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms