Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl3lE9PWZ3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3lE9PWZ3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3lE9PWZ3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3lE9PWZ3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3lE9PWZ3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl3lE9PWZ3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms