Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim30dE9PWL0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim30dE9PWL0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30dE9PWL0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30dE9PWL0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30dE9PWL0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30dE9PWL0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30dE9PWL0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30dE9PWL0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30dE9PWL0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30dE9PWL0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30dE9PWL0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30dE9PWL0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim30dE9PWL0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim30dE9PWL0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms