Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms