Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc6D3YZP9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc6D3YZP9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc6D3YZP9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms