Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc170D3YXL0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc170D3YXL0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms