Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BC048679D3YXE9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms