Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm17333C6EQI3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17333C6EQI3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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