Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd8B9EJ80 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd8B9EJ80 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd8B9EJ80 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd8B9EJ80 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd8B9EJ80 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd8B9EJ80 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd8B9EJ80 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd8B9EJ80 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd8B9EJ80 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd8B9EJ80 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd8B9EJ80 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdzd8B9EJ80 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms