Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam71aB7XG49 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam71aB7XG49 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam71aB7XG49 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms