Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cspp1B2RX88 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cspp1B2RX88 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cspp1B2RX88 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms