Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cfap58B2RW38 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cfap58B2RW38 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms