Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clrn2B2RVW2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clrn2B2RVW2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.3 ms