Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hbb-bh2B2RVB7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hbb-bh2B2RVB7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms