Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
AU022751B1B0V2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AU022751B1B0V2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
AU022751B1B0V2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AU022751B1B0V2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms