Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nipsnap3aB1AWZ3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms