Protein–RNA interactions for Protein: B1AVH7

Tbc1d2, TBC1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2B1AVH7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbc1d2B1AVH7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbc1d2B1AVH7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbc1d2B1AVH7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms