Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slfn8B1ARD8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slfn8B1ARD8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 290 ms