Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r232A2RTT5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms