Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms