Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Patl2A2ARM1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Patl2A2ARM1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms