Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms