Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc183A2AJB1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc183A2AJB1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms