Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyb561d1A2AE42 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyb561d1A2AE42 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms