Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rbbp8nlA2ABX0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms