Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbf1A2A870 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbf1A2A870 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms