Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pabpc1lA2A5N3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc1lA2A5N3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms