Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YCZ6

1700016G14Rik, RIKEN cDNA 1700016G14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016G14RikA0A286YCZ6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms